要去除知网查重水印文件，首先需要使用专业的去水印工具。可以尝试使用PS或其他图片处理软件进行处理，通过调整图层、透明度等参数来尝试去除水印。另外，也可以尝试使用文字识别软件将水印区域识别出来，再进行删除。需要注意的是，去除水印可能会对文件原始内容造成影响，建议在备份文件的基础上进行操作。

除了使用软件工具外，还可以尝试打印文件后再扫描的方法来去除知网查重水印文件。通过打印后再次扫描，水印可能会因为扫描质量的原因而减弱或消失。此外，也可以尝试调整扫描设置，如调整分辨率、色彩模式等参数，以期望减弱水印的影响。但需要注意的是，这种方法可能会降低文件的清晰度，建议在操作前做好文件备份。